تشيبي
الكيانات الكيميائية الاهتمام بالتنوع ، المعروف أيضا باسم الكيانات الكيميائية للأهمية البيولوجية ، [1] [2] هو قاعدة بيانات الكيميائية و الأنطولوجيا من الكيانات الجزيئية ركزت على مركبات كيميائية "صغيرة"، وهذا هو جزء من توسيع الطبية الحيوية الأونتولوجي جهد (OBO) في المعلوماتية الحيوية الأوروبي معهد (EBI). يشير مصطلح "الكيان الجزيئي" على أي "دستوريا أو نظائريا متميزة ذرة ، جزيء ، أيون ، زوج أيون ، جذري ، ايون جذري ، معقدة ، الملتزم، وما إلى ذلك، التعرف ككيان متميز على حدة ". [3] والكيانات الجزيئية في المسألة هي إما منتجات الطبيعة أو المنتجات الصناعية التي لها النشاط الحيوي المحتملين. الجزيئات المشفرة مباشرة من الجينوم، مثل الأحماض النووية ، البروتينات و الببتيدات المستمدة من لا يتم تضمين البروتينات عن طريق الانقسام الحال للبروتين ، كقاعدة في ChEBI.
 | |
|---|---|
| محتوى | |
| وصف | قاعدة بيانات كيميائية |
| أنواع البيانات الملتقطة | مركبات كيميائية صغيرة |
| اتصال | |
| مركز البحث | مختبر البيولوجيا الجزيئية الأوروبي  |
| معمل | المعهد الأوروبي للمعلوماتية الحيوية  |
| الاقتباس الأساسي | دي ماتوس وآخرون [1] |
| وصول | |
| موقع إلكتروني | www .ebi .ac .uk / chebi |
| تحميل URL | ftp .ebi .ac .uk / pub / databases / chebi |
| عنوان URL لخدمة الويب | شبكة الاتصالات العالمية .ebi .ac .uk / الكيانات الكيميائية للأهمية البيولوجية / خدمات ويب . هل |
| نقطة نهاية Sparql | BIO2RDF |
| أدوات | |
| الويب | www .ebi .ac .uk / chebi |
| متفرقات | |
تكرار إصدار البيانات | شهريا |
| سياسة التنظيم | منسق يدويًا |
يستخدم ChEBI التسميات والرمزية والمصطلحات التي أقرها الاتحاد الدولي للكيمياء البحتة والتطبيقية (IUPAC) ولجنة التسمية التابعة للاتحاد الدولي للكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية (NC-IUBMB).
النطاق والوصول
جميع البيانات الموجودة في قاعدة البيانات غير مملوكة أو مشتقة من مصدر غير مملوك. وبالتالي فهي متاحة مجانًا ومتاحة لأي شخص. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن تتبع كل عنصر بيانات بالكامل وإشارته صراحة إلى المصدر الأصلي. يرتبط في نطاق قواعد البيانات الأخرى مثل ChEMBL و ChemSpider و DrugBank و MetaboLights و PubChem .
تتوفر بيانات الكيانات الكيميائية للأهمية البيولوجية خلال العام تطبيقات الويب ، خدمات الويب ، SPARQL نقطة النهاية والتنزيلات. [1] [2]
مراجع
- ^ a b c de Matos P ، Alcántara R ، Dekker A ، Ennis M ، Hastings J ، Haug K ، Spiteri I ، Turner S ، Steinbeck C (2010). "الكيانات الكيميائية ذات الأهمية البيولوجية: تحديث" . بحوث الأحماض النووية . 38 (إصدار قاعدة البيانات): D249-54. دوى : 10.1093 / nar / gkp886 . PMC 2808869 . بميد 19854951 .
- ^ أ ب Degtyarenko K ، de Matos P ، Ennis M ، Hastings J ، Zbinden M ، McNaught A ، Alcántara R ، Darsow M ، Guedj M ، Ashburner M (2008). "ChEBI: قاعدة بيانات وأنطولوجيا للكيانات الكيميائية ذات الأهمية البيولوجية" . بحوث الأحماض النووية . 36 (إصدار قاعدة البيانات): D344-50. دوى : 10.1093 / nar / gkm791 . PMC 2238832 . بميد 17932057 .
- ^ IUPAC ، خلاصة وافية للمصطلحات الكيميائية ، الطبعة الثانية. ("الكتاب الذهبي") (1997). النسخة المصححة على الإنترنت: (2006–) " الكيان الجزيئي ". دوى : 10.1351 / goldbook.M03986